Jan Stanisław Jankowski urodził się w miejscowości Krasowo Wielkie (obecne województwo podlaskie) 6 maja 1882 r. Jego rodzice, Józef i Julianna, mieli tam majątek ziemski. W roku 1900 zdał maturę w gimnazjum w Piotrkowie Trybunalskim i rozpoczął studia na Uniwersytecie Warszawskim na wydziale fizyko-matematycznym. Rok później zmienił kierunek studiów na chemiczny w Warszawskim Instytucie Politechnicznym. Edukację zakończył w roku 1908 w Pradze, uzyskując tytuł inżyniera chemika na tamtejszej Politechnice. Do roku 1913 był asystentem w katedrze chemii rolnej Uniwersytetu Jagiellońskiego potem zarządzał majątkami ziemskimi Bendry, Byszew, Kalinowa.

Jankowski już podczas studiów był aktywny politycznie. W 1901 roku wstąpił do Związku Młodzieży Polskiej „Zet” oraz do Stronnictwa Narodowo-Demokratycznego, w roku 1906 współorganizował Narodowy Związek Robotniczy. Był również członkiem Komisji tymczasowej Skonfederowanych Stronnictw Niepodległościowych. Po wybuchu I wojny służył w I Kompanii Kadrowej Józefa Piłsudskiego, a następnie w I Pułku Ułanów Legionów Polskich. Uzyskał stopień kaprala. W okresie tym był też członkiem Centralnego Komitetu Narodowego z ramienia NZR.

​

​